More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0076 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 
418 aa  864  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  60.55 
 
 
311 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  60.49 
 
 
311 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  46.71 
 
 
340 aa  283  3e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  50.38 
 
 
334 aa  266  6e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  45.94 
 
 
308 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  49.81 
 
 
335 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  46.79 
 
 
299 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  45.36 
 
 
307 aa  262  9e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  44.79 
 
 
304 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  40.75 
 
 
351 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  38.2 
 
 
437 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  38.58 
 
 
316 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  37.22 
 
 
316 aa  191  3e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  37.86 
 
 
347 aa  166  6e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  37.12 
 
 
373 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.38 
 
 
297 aa  80.5  5e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.13 
 
 
308 aa  77.8  3e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.19 
 
 
265 aa  76.3  9e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  25.71 
 
 
270 aa  72  2e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.29 
 
 
267 aa  72  2e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  26.76 
 
 
265 aa  70.5  5e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  25.94 
 
 
273 aa  70.5  5e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  26.76 
 
 
265 aa  70.5  5e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  25.21 
 
 
270 aa  70.1  6e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  27.18 
 
 
275 aa  69.7  9e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  25.34 
 
 
282 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.41 
 
 
267 aa  69.3  1e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  27.15 
 
 
282 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  25.34 
 
 
282 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  26.64 
 
 
265 aa  69.3  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  25.34 
 
 
282 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  27.41 
 
 
267 aa  68.6  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.09 
 
 
279 aa  68.9  2e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  24.88 
 
 
268 aa  68.9  2e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  25.65 
 
 
285 aa  67.8  4e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.33 
 
 
268 aa  67  6e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  23.81 
 
 
266 aa  66.6  7e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.04 
 
 
267 aa  67  7e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  25.41 
 
 
307 aa  66.6  8e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  25.58 
 
 
277 aa  66.6  8e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  24.05 
 
 
271 aa  66.6  8e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.41 
 
 
307 aa  66.6  8e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  25 
 
 
268 aa  65.9  1e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  23.39 
 
 
272 aa  65.5  2e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.15 
 
 
267 aa  65.5  2e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  23.33 
 
 
268 aa  65.1  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.98 
 
 
307 aa  64.7  3e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.12 
 
 
324 aa  64.3  4e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.32557e-06  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.1 
 
 
855 aa  63.9  5e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  23.33 
 
 
267 aa  63.9  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.33 
 
 
267 aa  63.9  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  22.6 
 
 
267 aa  63.5  6e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  28.06 
 
 
620 aa  63.5  6e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  24.14 
 
 
272 aa  63.5  6e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  29.65 
 
 
304 aa  63.5  7e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  25.47 
 
 
269 aa  63.2  9e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.88 
 
 
306 aa  62  2e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.17 
 
 
286 aa  61.6  2e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.68 
 
 
310 aa  62  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  21.9 
 
 
267 aa  62  2e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.98 
 
 
297 aa  62  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  26.44 
 
 
283 aa  61.2  3e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.77 
 
 
334 aa  61.6  3e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  26.44 
 
 
283 aa  61.2  3e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  23.81 
 
 
268 aa  61.2  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  26.44 
 
 
283 aa  61.2  3e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  24.19 
 
 
272 aa  61.2  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  25.42 
 
 
280 aa  61.2  3e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.14 
 
 
304 aa  60.8  4e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.98 
 
 
297 aa  60.8  4e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70492e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.98 
 
 
297 aa  60.8  5e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.98 
 
 
297 aa  60.8  5e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  23.98 
 
 
273 aa  60.5  6e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  25.31 
 
 
346 aa  60.1  7e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.98 
 
 
297 aa  60.1  8e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.53 
 
 
326 aa  59.7  9e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  23.58 
 
 
266 aa  59.3  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  26.54 
 
 
335 aa  59.7  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.22 
 
 
295 aa  58.5  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  29.21 
 
 
319 aa  58.9  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  25.39 
 
 
260 aa  58.2  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  29.38 
 
 
302 aa  58.2  3e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  21.63 
 
 
307 aa  58.2  3e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  21.69 
 
 
267 aa  58.2  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  21.63 
 
 
278 aa  58.2  3e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58877e-09 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  21.69 
 
 
267 aa  58.2  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.6 
 
 
297 aa  58.2  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  23.56 
 
 
270 aa  57.8  4e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  23.11 
 
 
266 aa  57.8  4e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.12 
 
 
267 aa  57.8  4e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  21.76 
 
 
280 aa  57  6e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  24.74 
 
 
260 aa  56.6  7e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  25.12 
 
 
270 aa  56.6  8e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  22.86 
 
 
268 aa  56.6  9e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>