50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0075 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  64.58 
 
 
103 aa  135  3e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  65.96 
 
 
104 aa  129  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  58.82 
 
 
134 aa  112  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  55.67 
 
 
178 aa  110  8e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  55.91 
 
 
147 aa  109  1e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  57.61 
 
 
104 aa  108  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  60 
 
 
99 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  56.52 
 
 
104 aa  106  8e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  56.04 
 
 
97 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  54.65 
 
 
126 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  54.65 
 
 
126 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  54.65 
 
 
126 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  56.72 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  44.32 
 
 
101 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  40.19 
 
 
174 aa  70.1  9e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  49.15 
 
 
152 aa  58.2  4e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  55.1  3e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  54.3  5e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  35.44 
 
 
123 aa  53.9  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  42.37 
 
 
201 aa  53.9  7e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 
121 aa  53.1  1e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  52.38 
 
 
66 aa  52.4  2e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  38.33 
 
 
126 aa  51.2  4e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  43.14 
 
 
126 aa  50.8  7e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 
104 aa  48.5  3e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 
64 aa  47  9e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 
64 aa  47  9e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 
64 aa  47  9e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  31.08 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 
74 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.68 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  43.48 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  40.91 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  27.03 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.68 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  48.84 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  36 
 
 
70 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.19 
 
 
71 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  46.51 
 
 
95 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  36 
 
 
70 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  46.51 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.86 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  44.19 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>