18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0074 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
157 aa  311  3e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  65.44 
 
 
153 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  75.1  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  47.44 
 
 
114 aa  73.9  8e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  46.34 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  42.35 
 
 
96 aa  68.6  3e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  48.05 
 
 
96 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  48.05 
 
 
96 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  48.05 
 
 
96 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  42.31 
 
 
116 aa  66.2  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  47.3 
 
 
157 aa  65.1  3e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  47.3 
 
 
120 aa  64.7  4e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  44.29 
 
 
110 aa  60.8  6e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  44.29 
 
 
110 aa  60.8  6e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  39.47 
 
 
110 aa  54.7  4e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  41.07 
 
 
123 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  39.62 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>