264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0060 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  60.13 
 
 		 171 aa  201  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  43.24 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  39.24 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  39.51 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  35.85 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  31.94 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  32.68 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  28.1 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  33.55 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  29.14 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  29.14 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  32.45 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  29.87 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  29.87 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  28.57 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  27.74 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  32.67 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  26.28 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.71 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  29.85 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  26.06 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.2 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.34 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.7 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.97 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  28.35 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  28.35 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  29.3 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  29.81 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.7 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  24.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.4 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  26.06 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  24.17 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  31.86 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.47 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  29.46 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30.77 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.87 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  33.8 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.95 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  28.57 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  27.87 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  33.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  28.07 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  25.17 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  26.96 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  22.5 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  25.64 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  24.66 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  22.5 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  26.92 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.19 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.46 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.17 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.36 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.07 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.46 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  24.44 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  23.89 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25.87 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  31.43 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.1 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.1 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  27.14 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  25.74 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.22 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.9 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  24.5 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  25 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.92 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  24.5 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  30 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  25 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  25.74 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  26.89 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.48 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  23.48 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  23.48 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  30.34 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  23.48 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  29.82 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  24.49 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  25.48 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.52 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  28.57 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.74 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.14 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.52 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  23.48 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  24.66 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  24.66 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  21.26 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  24.66 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  24.66 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  24.44 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>