57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0049 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
944 aa  1949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  34.67 
 
 
872 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  47.91 
 
 
852 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.02 
 
 
1475 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.04 
 
 
1234 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.2 
 
 
1235 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.2 
 
 
1235 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.56 
 
 
773 aa  97.8  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25 
 
 
725 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.75 
 
 
649 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.43 
 
 
805 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.46 
 
 
1148 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.29 
 
 
766 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.29 
 
 
1343 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  26.58 
 
 
799 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.81 
 
 
1174 aa  80.1  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  21.89 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  23.9 
 
 
1002 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.79 
 
 
762 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  25.07 
 
 
647 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.79 
 
 
762 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.82 
 
 
801 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.58 
 
 
949 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.87 
 
 
1150 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.4 
 
 
953 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.23 
 
 
1067 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.67 
 
 
1247 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.42 
 
 
1091 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.76 
 
 
911 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.25 
 
 
1190 aa  59.7  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  25.49 
 
 
1335 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  23.9 
 
 
1216 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.81 
 
 
997 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.23 
 
 
908 aa  58.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  21.37 
 
 
1053 aa  57.4  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  21.98 
 
 
1237 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.65 
 
 
570 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.79 
 
 
951 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  21.96 
 
 
1049 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  22.09 
 
 
1049 aa  55.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  24.04 
 
 
818 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  24.7 
 
 
1080 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  23.67 
 
 
783 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.73 
 
 
942 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  22.12 
 
 
969 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.54 
 
 
1023 aa  52  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  20.62 
 
 
1065 aa  50.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.72 
 
 
2216 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  30.38 
 
 
1004 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.92 
 
 
1044 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  20.81 
 
 
1007 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  24.55 
 
 
260 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  24.1 
 
 
1075 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.15 
 
 
1183 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.28 
 
 
887 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.27 
 
 
1041 aa  45.8  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.09 
 
 
951 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>