More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0032 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
149 aa  296  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  81.82 
 
 
150 aa  235  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  72.41 
 
 
152 aa  213  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 
153 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 
153 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  69.23 
 
 
150 aa  203  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.63 
 
 
152 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 
149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 
150 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 
150 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  63.95 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.54 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.07 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
150 aa  167  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 
155 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
148 aa  163  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 
151 aa  160  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 
158 aa  159  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
156 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  56 
 
 
191 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 
151 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
145 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
151 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
147 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
145 aa  157  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
159 aa  157  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 
157 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
150 aa  156  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
142 aa  156  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.74 
 
 
148 aa  156  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 
148 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
146 aa  156  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 
156 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 
145 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
153 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
147 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 
163 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
145 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
156 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
152 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
159 aa  154  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
159 aa  154  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 
155 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
156 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
156 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.78 
 
 
145 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 
142 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 
155 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 
162 aa  153  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
146 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
144 aa  153  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
159 aa  153  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
159 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 
149 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
156 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 
150 aa  151  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
145 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
151 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 
148 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
148 aa  151  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.24 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
150 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
145 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
146 aa  150  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 
150 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 
150 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
176 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
159 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
151 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
160 aa  150  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  54.96 
 
 
144 aa  150  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 
145 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
160 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 
157 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  54.62 
 
 
147 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.08 
 
 
147 aa  148  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
153 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
156 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 
141 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
151 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
176 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
151 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 
149 aa  147  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 
207 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.03 
 
 
149 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>