240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0051 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  92.55 
 
 		 94 bp  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  90.43 
 
 		 94 bp  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  89.25 
 
 		 93 bp  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  88.17 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  88.17 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  87.67 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  91.84 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 97 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000328562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0041  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.368592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  88 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  82.8 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0097  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000565734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  82.8 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0001  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>