79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2762 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  100 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  42.06 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  41.67 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  37.5 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  39.82 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  40.71 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40.71 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  44.83 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  38.94 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  38.94 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  38.94 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  38.94 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  38.94 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  38.94 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  38.94 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  36.94 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  34.26 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  37.39 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  39.29 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.46 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.5 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  34.83 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  34.83 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  50.75 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  45.33 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  40 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  39.53 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  43.28 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  33.06 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  42.67 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  40.51 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  32.77 
 
 
117 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  37.33 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  32.5 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0708  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  30.59 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  28.74 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  29.31 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  38.64 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  36.96 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  38.64 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.97 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  28.97 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.08 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  31.52 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  39.51 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  30.97 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  33.33 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  26.37 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  34.18 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  31.13 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  27.03 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  39.02 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  29.81 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf882  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
112 aa  42  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  30.68 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  30.86 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  30.86 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  28.57 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
162 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>