More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2758 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
455 aa  900    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  47.15 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  46.51 
 
 
463 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  46.41 
 
 
460 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  47.63 
 
 
460 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  45.1 
 
 
461 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 
461 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  46.15 
 
 
455 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  46.85 
 
 
461 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.64 
 
 
455 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 
458 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  47.51 
 
 
455 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  45.77 
 
 
458 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  45.77 
 
 
458 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  43.82 
 
 
462 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 
461 aa  365  1e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  47.4 
 
 
456 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 
458 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  41.58 
 
 
465 aa  359  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  42.86 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  44.01 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  42.05 
 
 
458 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  42.42 
 
 
458 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  42.48 
 
 
462 aa  355  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 
458 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 
458 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 
458 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 
458 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  42.3 
 
 
458 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 
456 aa  352  8e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  41.99 
 
 
458 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  41.99 
 
 
458 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 
458 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 
457 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  42.42 
 
 
456 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  42.67 
 
 
455 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  44.1 
 
 
450 aa  348  8e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 
461 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 
459 aa  345  8e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 
459 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 
459 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  43.45 
 
 
450 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  43.53 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.21 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  43.98 
 
 
459 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  38.94 
 
 
436 aa  328  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
464 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  40.44 
 
 
460 aa  323  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  43.57 
 
 
459 aa  321  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 
473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
464 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
459 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.04 
 
 
460 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 
461 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.04 
 
 
460 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 
463 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 
467 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  39.61 
 
 
469 aa  316  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 
460 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 
476 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.39 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 
471 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 
454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  40.51 
 
 
452 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 
456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 
473 aa  302  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 
460 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 
455 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  38.54 
 
 
475 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 
461 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 
448 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 
459 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.32 
 
 
518 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 
446 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 
454 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 
456 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
457 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 
446 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 
456 aa  285  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  41.05 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  38.98 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>