More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2672 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  33.65 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
219 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 
195 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
244 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 
200 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 
191 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2922  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  35.78 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
504 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.71 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
464 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
296 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
503 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
135 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 
380 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
466 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
201 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  34.78 
 
 
348 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
229 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.7 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  41.67 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
374 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.29 
 
 
206 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  38.36 
 
 
467 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
202 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  34.29 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
283 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  36.51 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 
459 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  29.07 
 
 
475 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
474 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  29.9 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.44 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  32.43 
 
 
227 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  40.32 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>