63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2663 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  100 
 
 
301 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  63.51 
 
 
302 aa  361  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  56.76 
 
 
293 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50.97 
 
 
334 aa  278  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  48.21 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.89 
 
 
292 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  45.79 
 
 
319 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.58 
 
 
314 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.3 
 
 
305 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.92 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  40.2 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.14 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.26 
 
 
318 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.94 
 
 
318 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.02 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.77 
 
 
351 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.41 
 
 
329 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.93 
 
 
340 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.64 
 
 
359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.26 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.67 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.9 
 
 
313 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  33.7 
 
 
356 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  29.02 
 
 
301 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  27.96 
 
 
316 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.21 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.78 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  33.02 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  29.77 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.66 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.19 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.97 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.81 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.63 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.06 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  31.16 
 
 
327 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.86 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.14 
 
 
291 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  30.09 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.03 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.67 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.36 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.51 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.7 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.19 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  27.45 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.72 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  32.77 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.91 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.06 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.92 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  23.18 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  26.42 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  26.71 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  24.31 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.21 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  23.61 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  37.08 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  41.94 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  23.96 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  20.81 
 
 
324 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  22.39 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>