52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2660 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  55.76 
 
 
163 aa  207  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  49.69 
 
 
165 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  50.62 
 
 
169 aa  167  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.48 
 
 
165 aa  165  3e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  47.31 
 
 
169 aa  163  2e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  45.34 
 
 
168 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.56 
 
 
170 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.33 
 
 
168 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  43.03 
 
 
169 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  39.39 
 
 
165 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 
177 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.27 
 
 
162 aa  137  9e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.65 
 
 
178 aa  134  1e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  42.59 
 
 
199 aa  130  1e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  39.76 
 
 
171 aa  129  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.12 
 
 
199 aa  128  5e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  41.36 
 
 
165 aa  125  4e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.15 
 
 
170 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  38.41 
 
 
169 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  43.21 
 
 
168 aa  119  2e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  39.13 
 
 
161 aa  111  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.34057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.36 
 
 
165 aa  110  1e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 
177 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  31.64 
 
 
180 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  32.37 
 
 
186 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  37.2 
 
 
166 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.04 
 
 
159 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 
173 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  34.76 
 
 
162 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76613e-06 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.73 
 
 
172 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  40 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  35.98 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.06 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  36.25 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  32.96 
 
 
192 aa  94.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
167 aa  81.6  6e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
166 aa  79  4e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  29.63 
 
 
169 aa  78.6  5e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  36.64 
 
 
127 aa  73.9  1e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  35.76 
 
 
162 aa  73.2  2e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  25.31 
 
 
172 aa  72.4  4e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  25.29 
 
 
171 aa  55.1  5e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.67 
 
 
198 aa  51.2  8e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.52 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  21.08 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.41 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.64 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>