163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2569 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
363 aa  719    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  99.45 
 
 
363 aa  717    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  39.53 
 
 
743 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
106 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  36.69 
 
 
778 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.17 
 
 
1679 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.5 
 
 
469 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.31 
 
 
821 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.59 
 
 
835 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.61 
 
 
837 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  35.21 
 
 
784 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.43 
 
 
818 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  36.94 
 
 
792 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  36.77 
 
 
776 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  35.64 
 
 
593 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.24 
 
 
1919 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  30.7 
 
 
911 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  36.23 
 
 
1129 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.36 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.36 
 
 
554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.01 
 
 
553 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  31.77 
 
 
2082 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.05 
 
 
461 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  34.64 
 
 
726 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  34.02 
 
 
717 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.82 
 
 
561 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  34.49 
 
 
714 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.3 
 
 
461 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
560 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  33.83 
 
 
579 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  33.33 
 
 
376 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  34.73 
 
 
558 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  30.23 
 
 
449 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.29 
 
 
706 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.6 
 
 
624 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.49 
 
 
563 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.75 
 
 
558 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.66 
 
 
477 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  31.45 
 
 
807 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.19 
 
 
1848 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.26 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  34.28 
 
 
443 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  34.56 
 
 
681 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  35.33 
 
 
1222 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
569 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.23 
 
 
556 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.77 
 
 
546 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  30.09 
 
 
551 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.39 
 
 
597 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.53 
 
 
570 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.21 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  33.98 
 
 
389 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.42 
 
 
900 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.15 
 
 
567 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.96 
 
 
737 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  30.66 
 
 
577 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.48 
 
 
810 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  29.83 
 
 
553 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.46 
 
 
554 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  29.49 
 
 
566 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.46 
 
 
921 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 
638 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.4 
 
 
1126 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  30.75 
 
 
1312 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.41 
 
 
692 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.59 
 
 
618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.41 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
745 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  27.76 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.14 
 
 
396 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.46 
 
 
1187 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.49 
 
 
558 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.01 
 
 
727 aa  99.4  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  28.53 
 
 
447 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  29.75 
 
 
499 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.68 
 
 
787 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.03 
 
 
941 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.7 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.52 
 
 
728 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.43 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  29.53 
 
 
298 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  32.03 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
1207 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.89 
 
 
602 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  25.87 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.88 
 
 
535 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.16 
 
 
643 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  24.64 
 
 
547 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  27.89 
 
 
533 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  28.67 
 
 
643 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  27.83 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  24.1 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.87 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  28.05 
 
 
544 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  28.62 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  36.23 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  26.57 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.62 
 
 
2367 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>