More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2467 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 410 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4492  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3505  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3628  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422451  normal  0.286276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 321 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 380 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3305  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875341  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  25.23 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5734  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  38.37 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  23.68 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.57 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 504 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 737 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 513 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  30.14 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 		 364 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.87 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  36.21 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  36.21 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>