More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2329 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 773 aa  1548    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 766 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  23.99 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 764 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 267 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 546 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 506 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 544 aa  104  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  22.87 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  21.79 
 
 		 538 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  25.06 
 
 		 542 aa  96.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  21.36 
 
 		 793 aa  95.9  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 532 aa  95.5  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  22.19 
 
 		 548 aa  94  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 766 aa  91.3  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 365 aa  91.3  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 531 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 532 aa  88.6  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 519 aa  87.8  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 440 aa  84  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 530 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 259 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.62 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  21.6 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 778 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 778 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 526 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 291 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 775 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  36.22 
 
 		 529 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  36.51 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 258 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 233 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  25.4 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 409 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 259 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 259 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 409 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  25.58 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 284 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 288 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 316 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 301 aa  72  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 566 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 409 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 204 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 185 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 287 aa  72  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 285 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  26.56 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  28.18 
 
 		 299 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 278 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 508 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  39.53 
 
 		 198 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>