More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2316 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
411 aa  844  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  56.17 
 
 
413 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  56.52 
 
 
419 aa  468  1e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.99976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  57.83 
 
 
399 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.29 
 
 
432 aa  356  4e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  45.24 
 
 
448 aa  354  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  42.75 
 
 
413 aa  338  1e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  39.24 
 
 
395 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.56 
 
 
395 aa  262  7e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 
417 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.7173e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 
432 aa  255  1e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.57 
 
 
400 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  36.43 
 
 
400 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  40.99 
 
 
414 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  37.14 
 
 
414 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  36.16 
 
 
421 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 
423 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  36.32 
 
 
412 aa  232  7e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  36.32 
 
 
412 aa  232  8e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 
393 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  35.53 
 
 
412 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.76 
 
 
399 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  35.79 
 
 
412 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  36.05 
 
 
412 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.04 
 
 
409 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  34.77 
 
 
411 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 
410 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 
408 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.45 
 
 
409 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 
409 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 
410 aa  215  1e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  34.37 
 
 
409 aa  214  2e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.92 
 
 
413 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  33.07 
 
 
399 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.77 
 
 
415 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  32.16 
 
 
410 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
424 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 
409 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  34.26 
 
 
407 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  32.05 
 
 
417 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  33.84 
 
 
430 aa  198  1e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 
380 aa  197  2e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 
408 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  34.37 
 
 
410 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  31.87 
 
 
408 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.44 
 
 
359 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 
408 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  33.93 
 
 
422 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.25025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 
420 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.03 
 
 
414 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 
363 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
371 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.6 
 
 
389 aa  190  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  35.63 
 
 
378 aa  190  3e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  35.19 
 
 
354 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.15 
 
 
391 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  32.91 
 
 
419 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  31.68 
 
 
390 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 
359 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  35.99 
 
 
359 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 
409 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  32.49 
 
 
359 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  31.68 
 
 
390 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
385 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  31.99 
 
 
419 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  30.51 
 
 
421 aa  185  1e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.65 
 
 
358 aa  185  1e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  39.06 
 
 
349 aa  184  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  32.24 
 
 
372 aa  185  2e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 
406 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  37.1 
 
 
354 aa  184  4e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  33.63 
 
 
385 aa  183  4e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  28.97 
 
 
435 aa  183  5e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  29.47 
 
 
429 aa  183  5e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 
413 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  28.43 
 
 
431 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  28.79 
 
 
429 aa  182  8e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  38.67 
 
 
349 aa  182  9e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  40.6 
 
 
353 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  28.42 
 
 
432 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.74 
 
 
363 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  33.04 
 
 
365 aa  181  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  28.9 
 
 
445 aa  181  3e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 
402 aa  180  5e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  28.9 
 
 
445 aa  179  6e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  40.17 
 
 
352 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  28.39 
 
 
453 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  32.29 
 
 
381 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  30.7 
 
 
418 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  30.7 
 
 
418 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  33.9 
 
 
359 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  30.23 
 
 
432 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  35.48 
 
 
357 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
356 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>