More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2298 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
663 aa  1325    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.96 
 
 
549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  25.37 
 
 
538 aa  180  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000469738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 
448 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
517 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 
608 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  33.01 
 
 
360 aa  94  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  29.83 
 
 
324 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.7 
 
 
504 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 
335 aa  93.2  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 
311 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 
335 aa  92.8  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 
417 aa  90.5  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 
448 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 
360 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 
489 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.75 
 
 
429 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 
621 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 
322 aa  88.2  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  36.3 
 
 
621 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  30.09 
 
 
323 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  30.69 
 
 
509 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.97 
 
 
586 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 
430 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 
380 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  33.54 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 
467 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 
530 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 
368 aa  79  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.36 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.67 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.83 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  29.14 
 
 
459 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 
402 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  34.21 
 
 
641 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 
322 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.99 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  29.57 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  31 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.68 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  28.74 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
430 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  31.61 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 
500 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
326 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  30.63 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.01 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 
407 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  28.19 
 
 
536 aa  72.4  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.98 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  24.36 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  22.18 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  30.26 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 
362 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 
321 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 
390 aa  70.1  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  28.74 
 
 
598 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
520 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.89 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0228  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  23.62 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 
586 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  28.69 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  28.63 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  29.66 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  27.27 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  33.78 
 
 
399 aa  67  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  26.98 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  31.69 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.26 
 
 
379 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 
416 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 
353 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 
411 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>