More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2253 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
465 aa  963    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 
468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
466 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
466 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
466 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 
466 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 
466 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
468 aa  549  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
470 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
465 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
465 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
465 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
469 aa  521  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
478 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
466 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
466 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
466 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
500 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
472 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
480 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
480 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
476 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
487 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
470 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
472 aa  495  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
494 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
485 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
493 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
479 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
487 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 
484 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
467 aa  482  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
474 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
459 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
455 aa  480  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
485 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
493 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
481 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
486 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 
465 aa  475  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
485 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
485 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
484 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
465 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
484 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
460 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
460 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
447 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
461 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  47.52 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
460 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
447 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
460 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
460 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
486 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
448 aa  458  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
498 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
461 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
469 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
483 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
459 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
459 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
494 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
499 aa  451  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
459 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
463 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>