More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2236 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  100 
 
 
478 aa  920    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.17 
 
 
515 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  25.91 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  26.05 
 
 
533 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  26.36 
 
 
520 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  23.47 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  22.69 
 
 
568 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  20.66 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  22.08 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2442  CheW domain protein  20.7 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.84 
 
 
136 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.59 
 
 
139 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2215  CheW-like protein  20.57 
 
 
492 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.46 
 
 
163 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  30.99 
 
 
301 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.93 
 
 
162 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  33.98 
 
 
154 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.11 
 
 
165 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.11 
 
 
165 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.06 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  36.76 
 
 
151 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.85 
 
 
159 aa  84.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  36.76 
 
 
148 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.73 
 
 
164 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.78 
 
 
165 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.26 
 
 
164 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.79 
 
 
189 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.56 
 
 
165 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.56 
 
 
165 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.53 
 
 
163 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.61 
 
 
163 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.06 
 
 
167 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.64 
 
 
167 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.93 
 
 
146 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.36 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  25.81 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.75 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  20.54 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.87 
 
 
162 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  30.22 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  30.22 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  31.08 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.78 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  24.84 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.36 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  32.19 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  33.97 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  25 
 
 
161 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  35 
 
 
141 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.06 
 
 
148 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  32.61 
 
 
158 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  31.91 
 
 
228 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.88 
 
 
159 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  42.7 
 
 
141 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.87 
 
 
164 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.97 
 
 
159 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40 
 
 
158 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  32.61 
 
 
158 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  32.33 
 
 
139 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.41 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 
164 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.74 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.56 
 
 
163 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.39 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  28.78 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.74 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  27.63 
 
 
154 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  30.5 
 
 
161 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  33.55 
 
 
165 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.17 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  28.21 
 
 
201 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  34.65 
 
 
140 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  33.88 
 
 
164 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.74 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.12 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.34 
 
 
147 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.62 
 
 
145 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.85 
 
 
161 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.86 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.67 
 
 
163 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.86 
 
 
161 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.12 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.12 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.47 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.12 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  33.8 
 
 
160 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.47 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  28.57 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  33.55 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  31.37 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.65 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  33.64 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.12 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  36.45 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>