More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2216 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  52.02 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  31.17 
 
 
244 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  30.74 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  27.51 
 
 
271 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  28.44 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  28.44 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.48 
 
 
277 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  35.51 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.07 
 
 
300 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.69 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 
291 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  29.82 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.61 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.45 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.99 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  32.68 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.65 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.03 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  25.21 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.86 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  25 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.5 
 
 
601 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  24.53 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.21 
 
 
298 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  25.29 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  26.29 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.51 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.35 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  24.18 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.75 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.55 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  27.1 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.19 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  28.63 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  24.1 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  31.79 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.47 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3417  branched-chain amino acid aminotransferase  27.02 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  23.2 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  26.23 
 
 
306 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  25.6 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  31.07 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  24.67 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  24.77 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  28.99 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  31.07 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  24.63 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  27.91 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.38 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  24.4 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  33.65 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  24.24 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  23.98 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  28.99 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  26.13 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  26.92 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  26.51 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  27.52 
 
 
309 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  27.91 
 
 
592 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  24.24 
 
 
299 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
308 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>