More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2215 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 330 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  39.42 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  37.22 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  39.48 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.16 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.58 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  32.99 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.01 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.04 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.93 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.91 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  32.89 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  32.04 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.38 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.12 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  31.63 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.05 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  37 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.28 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  36.26 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  32.17 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  32.19 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.63 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.94 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.05 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.57 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.32 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.94 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  33.19 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.84 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  31.69 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  31.75 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.96 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.08 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.55 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.94 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.92 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.11 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  31.77 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  28.79 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.35 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  32.46 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.69 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  29.02 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.56 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.08 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.67 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  26.16 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.06 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.6 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.6 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.85 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  29.64 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.6 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.6 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.6 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.03 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.16 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.39 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.6 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.6 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.6 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.08 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  26.67 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.16 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.2 
 
 		 374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.34 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  28.17 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  25.78 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.78 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>