218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2183 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
451 aa  923    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  39.34 
 
 
473 aa  319  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  38.88 
 
 
473 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  37.95 
 
 
443 aa  249  9e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  34.35 
 
 
500 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  34.07 
 
 
482 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  35.59 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  35.23 
 
 
478 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  34.28 
 
 
480 aa  243  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  34.57 
 
 
480 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  34.79 
 
 
480 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  34.69 
 
 
498 aa  240  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  34.28 
 
 
486 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  34.57 
 
 
480 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  34.05 
 
 
484 aa  237  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  33.92 
 
 
474 aa  236  9e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  36.16 
 
 
462 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  33.92 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  33.48 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 
486 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  33.4 
 
 
484 aa  231  1e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  33.55 
 
 
477 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  33.68 
 
 
460 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  34.64 
 
 
486 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  35.09 
 
 
477 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  33.92 
 
 
477 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  34.87 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  33.26 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  33.41 
 
 
432 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  30.9 
 
 
493 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  32.49 
 
 
485 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  33.19 
 
 
484 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  32.54 
 
 
486 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  31.67 
 
 
485 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  31.58 
 
 
479 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  32.75 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  31.17 
 
 
488 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  31.1 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  32.17 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  32.76 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  34.29 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  31.66 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  33.12 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.85 
 
 
477 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  32.75 
 
 
477 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 
465 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  32.39 
 
 
482 aa  209  6e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  32.75 
 
 
481 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  33.41 
 
 
477 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  31.88 
 
 
476 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  31.72 
 
 
478 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  31.57 
 
 
480 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  35.48 
 
 
963 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  31.31 
 
 
482 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  31.87 
 
 
477 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  31.59 
 
 
476 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  31.24 
 
 
476 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  31.77 
 
 
487 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  31.83 
 
 
486 aa  203  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  29.69 
 
 
476 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  32.21 
 
 
487 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  30.65 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  31.77 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  30.87 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  31.02 
 
 
476 aa  200  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  31 
 
 
484 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  31.8 
 
 
475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  31 
 
 
502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  30.44 
 
 
475 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  31.67 
 
 
514 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  29.48 
 
 
475 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  30.3 
 
 
472 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  32.26 
 
 
486 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  31.19 
 
 
988 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 
476 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  31.75 
 
 
486 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  28.54 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.46 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.24 
 
 
396 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  32.06 
 
 
404 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  30.66 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  28.88 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  30.42 
 
 
393 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.96 
 
 
406 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.6 
 
 
401 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.73 
 
 
384 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.81 
 
 
408 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.86 
 
 
395 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.42 
 
 
393 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  30.84 
 
 
398 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.24 
 
 
404 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  30.6 
 
 
388 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  28.94 
 
 
408 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.34 
 
 
408 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.3 
 
 
399 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.38 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  27.99 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.38 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.34 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.34 
 
 
408 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>