More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2129 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 
571 aa  1159    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  57.05 
 
 
497 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  47.06 
 
 
559 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  50.31 
 
 
494 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  46.67 
 
 
564 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.42 
 
 
562 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  44.95 
 
 
503 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  45.58 
 
 
496 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  45.18 
 
 
496 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  45.38 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  43.4 
 
 
503 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  43.49 
 
 
530 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.46 
 
 
492 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  45.58 
 
 
500 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  44.4 
 
 
503 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  40.72 
 
 
487 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  41.6 
 
 
485 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.07 
 
 
497 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  42.63 
 
 
517 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.76 
 
 
496 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.07 
 
 
497 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  47.2 
 
 
416 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.76 
 
 
496 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.66 
 
 
492 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  44.42 
 
 
489 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  35.87 
 
 
636 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  43.11 
 
 
507 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  40.74 
 
 
488 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  42.74 
 
 
489 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  42.49 
 
 
502 aa  364  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.42 
 
 
543 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  42.95 
 
 
489 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  42.95 
 
 
489 aa  364  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  43.37 
 
 
489 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  42.95 
 
 
489 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  42.49 
 
 
502 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.19 
 
 
483 aa  362  9e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  42.49 
 
 
488 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  42.49 
 
 
502 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  42.49 
 
 
488 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  41.86 
 
 
488 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  41.38 
 
 
495 aa  360  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  41.43 
 
 
502 aa  361  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  41.65 
 
 
488 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  44.88 
 
 
908 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  41.56 
 
 
489 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  42.11 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.84 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  41.56 
 
 
489 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  41.56 
 
 
489 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.62 
 
 
483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.11 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  41.65 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  41.65 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.11 
 
 
489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  43.51 
 
 
491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  41.07 
 
 
502 aa  356  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  45.17 
 
 
990 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  45.68 
 
 
702 aa  356  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  37.91 
 
 
489 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  44.23 
 
 
1007 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  43.16 
 
 
493 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  39.92 
 
 
496 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  47.44 
 
 
860 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  47.44 
 
 
844 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  40.85 
 
 
499 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  41.26 
 
 
496 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.34 
 
 
490 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  38.13 
 
 
495 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  47.44 
 
 
868 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 
515 aa  352  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  41.27 
 
 
500 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  39.51 
 
 
496 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  43.78 
 
 
1334 aa  349  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  41.6 
 
 
487 aa  350  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.93 
 
 
495 aa  349  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  42.32 
 
 
489 aa  349  8e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  44.99 
 
 
474 aa  349  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  43.88 
 
 
1043 aa  349  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  42.71 
 
 
489 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  47.18 
 
 
740 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  43.79 
 
 
483 aa  348  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  40.21 
 
 
486 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  44.03 
 
 
483 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  44.36 
 
 
922 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.159287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>