More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2125 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
531 aa  1065    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.37 
 
 
531 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.82 
 
 
526 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.53 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.9 
 
 
526 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.56 
 
 
527 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.47 
 
 
534 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.34 
 
 
530 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.47 
 
 
532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.18 
 
 
527 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.8 
 
 
528 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.26 
 
 
523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.24 
 
 
527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.17 
 
 
523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.34 
 
 
527 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.76 
 
 
523 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.19 
 
 
526 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.79 
 
 
526 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.8 
 
 
527 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.81 
 
 
525 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.02 
 
 
526 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.75 
 
 
529 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.37 
 
 
546 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.21 
 
 
527 aa  433  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.98 
 
 
529 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.28 
 
 
524 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.89 
 
 
528 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.94 
 
 
525 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.94 
 
 
525 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.4 
 
 
524 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.59 
 
 
528 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.05 
 
 
527 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.05 
 
 
527 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.75 
 
 
528 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.56 
 
 
652 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.13 
 
 
527 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.4 
 
 
528 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.34 
 
 
535 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
528 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.4 
 
 
528 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.37 
 
 
527 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.45 
 
 
523 aa  422  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.83 
 
 
528 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.44 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.24 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.45 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.63 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.05 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.65 
 
 
542 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.31 
 
 
532 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.45 
 
 
523 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.64 
 
 
531 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
528 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
525 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.95 
 
 
523 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.7 
 
 
529 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.92 
 
 
529 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.76 
 
 
525 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.79 
 
 
527 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2694  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.08 
 
 
534 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.835584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.44 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.86 
 
 
528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1887  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.71 
 
 
528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.67 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.12 
 
 
539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.24 
 
 
530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.67 
 
 
523 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.62 
 
 
532 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.81 
 
 
541 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.11 
 
 
529 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.39 
 
 
528 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.92 
 
 
541 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40 
 
 
526 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.34 
 
 
525 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.76 
 
 
531 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.23 
 
 
531 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.35 
 
 
529 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
524 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.77 
 
 
529 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.04 
 
 
532 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.15 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.66 
 
 
531 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.35 
 
 
526 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1288  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.01 
 
 
531 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.605181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.23 
 
 
535 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.45 
 
 
533 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.72 
 
 
529 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
529 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  41.17 
 
 
526 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
531 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.58 
 
 
529 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.03 
 
 
531 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
529 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
531 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.45 
 
 
533 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.85 
 
 
531 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.39 
 
 
528 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.66 
 
 
539 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000359421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>