More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2108 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  46.08 
 
 		 763 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  48.59 
 
 		 792 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  52.61 
 
 		 806 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  56.33 
 
 		 758 aa  797    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  52.75 
 
 		 808 aa  758    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  52.75 
 
 		 804 aa  759    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  47.43 
 
 		 763 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  52.61 
 
 		 810 aa  757    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  52.61 
 
 		 806 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  52.61 
 
 		 812 aa  755    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  49.44 
 
 		 790 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  50.07 
 
 		 706 aa  736    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  57.71 
 
 		 722 aa  784    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  47.87 
 
 		 715 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  47.22 
 
 		 759 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  52.75 
 
 		 808 aa  758    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  52.47 
 
 		 792 aa  738    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  61.47 
 
 		 757 aa  850    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  49.72 
 
 		 770 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  51.69 
 
 		 814 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  55.78 
 
 		 762 aa  799    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  47.95 
 
 		 709 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  100 
 
 		 716 aa  1451    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  58.98 
 
 		 788 aa  875    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  49.93 
 
 		 706 aa  706    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  48.95 
 
 		 716 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  52.89 
 
 		 806 aa  759    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  49.44 
 
 		 790 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  54.64 
 
 		 751 aa  768    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  54.21 
 
 		 751 aa  762    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  52.61 
 
 		 808 aa  758    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  46.73 
 
 		 705 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  51.62 
 
 		 903 aa  699    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  46.09 
 
 		 710 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  46.09 
 
 		 710 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  44.74 
 
 		 777 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  46.2 
 
 		 737 aa  591  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  46.05 
 
 		 737 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  43.16 
 
 		 752 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  44.25 
 
 		 810 aa  585  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  45.15 
 
 		 766 aa  580  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  40.69 
 
 		 720 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  43.54 
 
 		 801 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  44.6 
 
 		 737 aa  557  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  43.51 
 
 		 779 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  44.08 
 
 		 708 aa  554  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  43.88 
 
 		 704 aa  550  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  39.19 
 
 		 827 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  42.78 
 
 		 751 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  41.45 
 
 		 863 aa  527  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  42.15 
 
 		 726 aa  526  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  41.56 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  44.08 
 
 		 801 aa  525  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  39.35 
 
 		 709 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  39.89 
 
 		 937 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  40.17 
 
 		 817 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  39.09 
 
 		 1182 aa  510  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  38.61 
 
 		 825 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  39.14 
 
 		 750 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  38.87 
 
 		 746 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  41.24 
 
 		 726 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  41.1 
 
 		 726 aa  505  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  39.48 
 
 		 818 aa  505  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  41.47 
 
 		 813 aa  505  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  38.87 
 
 		 746 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  40.17 
 
 		 755 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  38.69 
 
 		 803 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  40.2 
 
 		 813 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  40.2 
 
 		 813 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  37.96 
 
 		 840 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  40.2 
 
 		 813 aa  492  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  38.49 
 
 		 722 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  41.07 
 
 		 749 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  40.92 
 
 		 736 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  40.2 
 
 		 813 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  39.31 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  39.31 
 
 		 812 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  39.31 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  41.11 
 
 		 695 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  39.31 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  39.31 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  38.66 
 
 		 735 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  37.69 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  38.9 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  39.71 
 
 		 807 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  39.86 
 
 		 808 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  38.64 
 
 		 805 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  38.1 
 
 		 1055 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  41.7 
 
 		 701 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  37.99 
 
 		 857 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  39.71 
 
 		 807 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  37.71 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  38.44 
 
 		 836 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  39.71 
 
 		 807 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  39.57 
 
 		 808 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>