More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2097 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  58.51 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  58.06 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  58.51 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  58.51 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  50 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  50 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  46.81 
 
 		 95 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  46.81 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  47.25 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  45.05 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  40.66 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  41.94 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  43.33 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  37.63 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  37.63 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>