More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2096 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  100 
 
 
161 aa  323  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  66.67 
 
 
142 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  66.98 
 
 
138 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  58.1 
 
 
134 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  45.06 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  42.33 
 
 
150 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  51.43 
 
 
137 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 
172 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 
173 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 
164 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  53.33 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  52.38 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  44.17 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  54.55 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  48.6 
 
 
119 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  51.38 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  44.17 
 
 
142 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  41.26 
 
 
146 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  47.79 
 
 
140 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  38.41 
 
 
141 aa  104  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  37.65 
 
 
154 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  39.63 
 
 
156 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  47.62 
 
 
169 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  49.07 
 
 
139 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  47.62 
 
 
167 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  47.62 
 
 
167 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  48.57 
 
 
156 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  44.44 
 
 
114 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  48.57 
 
 
156 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  48.57 
 
 
156 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  48.57 
 
 
156 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  46.67 
 
 
142 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  46.67 
 
 
142 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  44.63 
 
 
146 aa  101  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  45.71 
 
 
187 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  48.11 
 
 
156 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  47.06 
 
 
148 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  43.41 
 
 
133 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  44.55 
 
 
166 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  36.2 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 
166 aa  99  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  46.53 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  46.96 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  46.08 
 
 
172 aa  97.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  45.69 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  38.03 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.13 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  48.15 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  43.81 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  34.67 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  44.07 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  46.08 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  49.04 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  34.68 
 
 
175 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  43.64 
 
 
129 aa  94.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  40.32 
 
 
157 aa  94  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  45.54 
 
 
150 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  45.54 
 
 
150 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  45.63 
 
 
141 aa  94  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  45.37 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.58 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  38.71 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  38.71 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  44.12 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  44.76 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.19 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40.19 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  46.08 
 
 
161 aa  92  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  42.34 
 
 
141 aa  92.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  40.74 
 
 
138 aa  91.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  44.23 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  45.1 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  41.44 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  43.56 
 
 
147 aa  90.5  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  44.66 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  41.61 
 
 
136 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 
111 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  39.6 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  43.56 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.89 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  43 
 
 
141 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  36.52 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 
111 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  36.52 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  40.54 
 
 
156 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  38.24 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>