More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2085 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 		 381 aa  792    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  52.62 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.91 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.3 
 
 		 328 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.13 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.23 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.81 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.65 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.27 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.44 
 
 		 333 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.91 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.89 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  33.65 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.7 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  34.97 
 
 		 337 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.55 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.58 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.18 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  32.06 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.92 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.15 
 
 		 326 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.77 
 
 		 328 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.39 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.39 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.85 
 
 		 334 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.48 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.48 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.13 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  33.02 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.39 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.43 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.54 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.24 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.35 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.35 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.35 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.35 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  28.35 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.32 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.35 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.34 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.1 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.83 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.1 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.64 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.94 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.82 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.08 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.12 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.95 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.11 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.43 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.71 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.76 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.95 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.93 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.12 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.36 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.2 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.12 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.5 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.68 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.36 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.93 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.63 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.71 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.63 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.78 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.43 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.93 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.93 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.82 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.76 
 
 		 437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.5 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.05 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.65 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.82 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.47 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.69 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.55 
 
 		 442 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.68 
 
 		 436 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 		 437 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.06 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.91 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.88 
 
 		 437 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.94 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.04 
 
 		 461 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.74 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.1 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.08 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.49 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.39 
 
 		 304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>