More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2038 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  56.34 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  47.74 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  48.64 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  50.59 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  48.64 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  50.39 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  50.19 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  48.64 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  50 
 
 		 278 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  48.5 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  48.81 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  45.1 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  45.21 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  45.21 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  48.84 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  46.83 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  46.83 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  43.68 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  47.23 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  46.18 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  44.66 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  45.04 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  45.42 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  45.91 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  46.25 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  45.04 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  48.34 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  45.21 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  45.52 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  45.88 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  45.42 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  42.21 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  43.13 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  42.05 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  42.05 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  42.21 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  43.3 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  43.3 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  42.16 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  43.89 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  41.6 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  41.67 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  41.29 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.37 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  44.36 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  41.35 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  44.22 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.3 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  39.55 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.92 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  40.44 
 
 		 308 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  42.46 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  39.3 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  42.52 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  41.22 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  41.22 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  40 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.16 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  43.24 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  40.15 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.05 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  39.38 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  43.72 
 
 		 292 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  40.16 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  40.38 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  43.08 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  41.11 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  39.18 
 
 		 360 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  38.22 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  38.22 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.55 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  40.3 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  42.17 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  37.76 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  40.55 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  37.84 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  36.84 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.08 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  39.2 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.92 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.78 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  39.76 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  40.64 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  39.45 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  39.37 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  40.68 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  42.97 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  38.4 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  42.06 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  41.96 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  42.06 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  39.53 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  38.26 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  42.06 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>