More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2036 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
562 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
561 aa  1147    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
564 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  57.9 
 
 
564 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
561 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
560 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
570 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
559 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
561 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
563 aa  588  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
564 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
557 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
556 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
554 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
550 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
559 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
554 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
554 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
559 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
556 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
556 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
556 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
553 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
553 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
556 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
556 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
556 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
556 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
556 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
556 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
553 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
556 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
586 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
589 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
589 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
592 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
551 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
586 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
584 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
551 aa  452  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
598 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
551 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
546 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
586 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
568 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
561 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
609 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
587 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
611 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
575 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
588 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
564 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
562 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
561 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
564 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
585 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
575 aa  422  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
587 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
579 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
579 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
587 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
550 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
550 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
570 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
549 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
556 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
609 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
551 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
563 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
609 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
551 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
569 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
550 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
550 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
543 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
553 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
522 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
557 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
542 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
562 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
562 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
553 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2879  arginyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
552 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
551 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
561 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
550 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>