172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1947 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  100 
 
 
283 aa  583  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  57.82 
 
 
298 aa  334  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  52.54 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  48.58 
 
 
313 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  47.84 
 
 
315 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  50.55 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  46.04 
 
 
319 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 
305 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  46.43 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  45.68 
 
 
300 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 
309 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 
300 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 
301 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 
305 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  45.32 
 
 
318 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  46.83 
 
 
303 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  47.18 
 
 
303 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 
312 aa  255  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 
301 aa  254  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  47.1 
 
 
320 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  47.1 
 
 
320 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 
323 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 
296 aa  248  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 
306 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 
287 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 
286 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 
286 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
319 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  43.25 
 
 
334 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  43.55 
 
 
326 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  40.93 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  40.93 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 
344 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 
334 aa  229  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  41.96 
 
 
334 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  39.12 
 
 
321 aa  225  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 
336 aa  225  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  45 
 
 
373 aa  225  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 
295 aa  225  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 
331 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 
303 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  39.06 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 
307 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 
373 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
355 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 
371 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 
372 aa  175  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  33.45 
 
 
345 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 
374 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 
373 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  24.62 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  25 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 
364 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.08 
 
 
353 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
367 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
363 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.4 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  23.97 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 
337 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
337 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
337 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  23.15 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  24.15 
 
 
338 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  22.9 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  24.16 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  26.55 
 
 
362 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  22.07 
 
 
358 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.78 
 
 
342 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 
396 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
339 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
348 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  23.73 
 
 
335 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  25.77 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>