38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1937 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
148 aa  299  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  55.97 
 
 
143 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  40.97 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  47.92 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  42.86 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  44.83 
 
 
172 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  36.81 
 
 
146 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  41.22 
 
 
156 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  42.66 
 
 
156 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  38.17 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  36.64 
 
 
148 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.11 
 
 
148 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  39.58 
 
 
182 aa  103  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  38.89 
 
 
154 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  38.22 
 
 
327 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  39.05 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  30.22 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  35.58 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  31.54 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  39.25 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  28.15 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  33.65 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  33.62 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  31.31 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  35.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  30.07 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  33.66 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  30.43 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.89 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.21 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  27.66 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  29.35 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  28.72 
 
 
257 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  30.08 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  29.57 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  33.7 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.78 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>