More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1910 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
462 aa  938    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
477 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
498 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.19 
 
 
468 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
477 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
468 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.19 
 
 
517 aa  193  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.51 
 
 
503 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 
477 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.97 
 
 
485 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.49 
 
 
493 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 
477 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 
477 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 
477 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
478 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
477 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
477 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.28 
 
 
477 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
477 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
481 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  24.79 
 
 
498 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.28 
 
 
490 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
477 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27 
 
 
480 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  29.65 
 
 
479 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 
461 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
477 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.22 
 
 
480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.08 
 
 
480 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
477 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28.99 
 
 
500 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
547 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
520 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.31 
 
 
474 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
468 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  26.7 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.7 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  25.81 
 
 
468 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  26.7 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  26.7 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.31 
 
 
474 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  27.31 
 
 
474 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.31 
 
 
474 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.31 
 
 
474 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  28.35 
 
 
456 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  25.85 
 
 
468 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  28.13 
 
 
456 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  25.16 
 
 
463 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
489 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
483 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
468 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  27.71 
 
 
456 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  28.18 
 
 
456 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  27.49 
 
 
456 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  29.42 
 
 
449 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  23.19 
 
 
484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
340 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
456 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  24.88 
 
 
509 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 
396 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.62 
 
 
488 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 
456 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  28.57 
 
 
456 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  27.49 
 
 
505 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  26.88 
 
 
440 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  25.69 
 
 
397 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
487 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
509 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
469 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
483 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.18 
 
 
477 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 
470 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
492 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
473 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
477 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
477 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  24.86 
 
 
397 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  26.54 
 
 
477 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
477 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
509 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
383 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  27.98 
 
 
443 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  24.67 
 
 
483 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  28.97 
 
 
344 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  26.54 
 
 
471 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.33 
 
 
477 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
569 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  27.85 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  24.5 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>