More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1892 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  100 
 
 
319 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  35.85 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  35.31 
 
 
298 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  39.18 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  35.6 
 
 
296 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
235 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  29.05 
 
 
536 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.15 
 
 
532 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  54.47 
 
 
255 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
532 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  31.82 
 
 
364 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.85 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  52.46 
 
 
178 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  30.03 
 
 
582 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  29.83 
 
 
582 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  40.49 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  29.51 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.67 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  30.03 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.03 
 
 
580 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  30.51 
 
 
579 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  44.88 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  49.19 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  30.33 
 
 
430 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
183 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  28.3 
 
 
598 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.69 
 
 
413 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.82 
 
 
420 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  29.82 
 
 
420 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
214 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  27.57 
 
 
578 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  29.62 
 
 
418 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  29.47 
 
 
420 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  29.47 
 
 
420 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  29.47 
 
 
420 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.09 
 
 
226 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.37 
 
 
391 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
188 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
208 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
208 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
232 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
207 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  45.07 
 
 
173 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  28.01 
 
 
556 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
212 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  27.76 
 
 
577 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
214 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
214 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.74 
 
 
217 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
203 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  27.91 
 
 
582 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42.62 
 
 
205 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  47.79 
 
 
303 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.26 
 
 
210 aa  102  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
208 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
208 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
207 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 
181 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
224 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  29.35 
 
 
426 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  40.31 
 
 
242 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  43.75 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.35 
 
 
426 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.54 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  29.04 
 
 
553 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  29.03 
 
 
549 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  43.75 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.64 
 
 
224 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  47.79 
 
 
221 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
234 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
223 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  43.85 
 
 
205 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
223 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  48.72 
 
 
231 aa  99.4  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.03 
 
 
432 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
177 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
177 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  42.64 
 
 
419 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.94 
 
 
170 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
246 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  39.84 
 
 
205 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  44.19 
 
 
202 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
207 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
391 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  30.75 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.29 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  43.08 
 
 
193 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  31.9 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.96 
 
 
221 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>