More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1856 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 793 aa  1564    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 267 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 779 aa  131  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2187  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.97772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 775 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  24.25 
 
 		 760 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 330 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 544 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 519 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 303 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.66 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  30.25 
 
 		 1384 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 766 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 284 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  34.91 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 332 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.71 
 
 		 329 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  24.15 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 298 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 409 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 322 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 523 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 336 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 383 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 535 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  30.39 
 
 		 285 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  29.27 
 
 		 292 aa  63.9  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 259 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 118 aa  63.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 409 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  35.29 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  24.63 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 508 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 315 aa  62  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 		 525 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>