39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1828 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1828  transcriptional repressor, CtsR  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000526756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0832  transcriptional repressor, CtsR  54.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0126757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0324  transcriptional repressor, CtsR  49.67 
 
 
152 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0151565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0076  transcriptional repressor, CtsR  49.33 
 
 
153 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1792  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  48.7 
 
 
153 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00840  transcriptional repressor, CtsR  44.67 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.292684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0080  transcriptional repressor, CtsR  48 
 
 
153 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000901486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0252  transcriptional repressor, CtsR  48.05 
 
 
158 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.393745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0078  transcriptional regulator CtsR  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0108  transcriptional regulator CtsR  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000174069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0099  transcriptional regulator CtsR  46.67 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00122977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0088  transcriptional regulator CtsR  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24686e-40 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0077  transcriptional regulator CtsR  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00235802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0074  transcriptional regulator  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.633336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0075  transcriptional regulator  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0078  transcriptional regulator CtsR  46 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0073  transcriptional repressor, CtsR  45.33 
 
 
153 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0073  transcriptional repressor, CtsR  45.33 
 
 
153 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00398786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5227  transcriptional regulator CtsR  45.33 
 
 
153 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000820485  hitchhiker  5.82448e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2440  transcriptional repressor  47.68 
 
 
151 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2754  transcriptional repressor  46.36 
 
 
151 aa  133  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0495199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0162  transcriptional regulator CtsR  42.86 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2743  transcriptional repressor, CtsR  47.06 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0544  transcriptional repressor, CtsR  43.54 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0558  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  43.54 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0177  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  42.86 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1495  transcriptional repressor, CtsR  43.06 
 
 
155 aa  120  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000151028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0178  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  39.87 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0513  transcriptional repressor of class III stress genes  39.58 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.162127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0108  class III stress gene transcriptional regulator  44.72 
 
 
151 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0386  transcriptional repressor, CtsR  38 
 
 
156 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0143  transcriptional repressor, CtsR  37.75 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1829  transcriptional regulator CtsR  45.53 
 
 
154 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0244225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0665  transcriptional repressor of class III stress genes  41.46 
 
 
151 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0159  transcriptional regulator  42.98 
 
 
122 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0124  transcriptional repressor, CtsR  40.52 
 
 
155 aa  104  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.407779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1405  transcriptional repressor, CtsR  36.08 
 
 
159 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1951  transcriptional repressor, CtsR  39.2 
 
 
155 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0224178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2370  transcriptional repressor of class III stress genes-like protein  37.04 
 
 
142 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000351373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>