277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1802 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 364 aa  734    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  42.58 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  50.79 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  36.41 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  34.62 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  35.14 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  33.76 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.64 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  32.82 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  31.37 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  25.21 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.5 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  34.12 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  32.43 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  32.5 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.45 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  32.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  32.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.61 
 
 		 609 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  27.32 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  30.06 
 
 		 741 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  36.69 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  35.56 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  33.88 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  29.12 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  35.56 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  32.93 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  25.23 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.71 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.65 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  26.2 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.88 
 
 		 525 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.62 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.69 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.37 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.62 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.74 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  27.7 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22.51 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  28.11 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  49.21 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  27.63 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  28.86 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  34.55 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  29.75 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.53 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  24.14 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  28.45 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  26.3 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  35.43 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  28.33 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.53 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  34.78 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.82 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>