More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1778 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  44.4 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.63 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  32.91 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.63 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3198  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 286 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.48 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.07 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.91 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  26.69 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3175  putative transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>