More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1769 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  49.66 
 
 
165 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  44.29 
 
 
157 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  45.03 
 
 
163 aa  133  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  44.3 
 
 
163 aa  131  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  50.78 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  41.84 
 
 
156 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  39.16 
 
 
171 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.69 
 
 
158 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40.6 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.6 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.57 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.86 
 
 
160 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  38.41 
 
 
159 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  34.93 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  34.93 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.71 
 
 
167 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  35.37 
 
 
162 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  38.69 
 
 
166 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  35.62 
 
 
165 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  35.62 
 
 
165 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 
165 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  35.62 
 
 
165 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  37.31 
 
 
162 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  37.59 
 
 
163 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  37.59 
 
 
163 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35 
 
 
164 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  34.25 
 
 
158 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.11 
 
 
156 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.86 
 
 
170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  31.54 
 
 
171 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  32.19 
 
 
171 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  37.21 
 
 
169 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.15 
 
 
169 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  32.19 
 
 
177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.86 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  32.19 
 
 
171 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  32.19 
 
 
177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.16 
 
 
164 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  36.62 
 
 
170 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  32.21 
 
 
171 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.29 
 
 
171 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.59 
 
 
185 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 
166 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.95 
 
 
183 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.86 
 
 
165 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  30.87 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.5 
 
 
167 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  33.57 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  34.23 
 
 
162 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.14 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  36.11 
 
 
169 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.54 
 
 
164 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  37.91 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  35 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.14 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  34.23 
 
 
162 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  32.14 
 
 
170 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  36.11 
 
 
169 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.14 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.31 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  36.76 
 
 
183 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  39.55 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  31.37 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.93 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.64 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.51 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.78 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  37.18 
 
 
187 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.1 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.48 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  32.88 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  31.13 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.61 
 
 
163 aa  98.2  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  37.4 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  37.4 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.59 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.96 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  34.06 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>