More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1722 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
75 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 
73 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
74 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
74 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
73 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 
85 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  75 
 
 
73 aa  122  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 
73 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
73 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
73 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
73 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 
90 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
72 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
73 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 
73 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 
73 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 
74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 
73 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
73 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 
73 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
73 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  117  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
73 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  75.34 
 
 
73 aa  117  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  73.97 
 
 
73 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
74 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
74 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
74 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
74 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
87 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  69.44 
 
 
73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 
74 aa  114  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  72.6 
 
 
73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  71.23 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>