More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1719 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 130 aa  203  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  71.88 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  71.88 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  71.88 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  70.23 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  68.85 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  79.69 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  67.21 
 
 		 131 aa  186  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  72.41 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  66.39 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  78.91 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  75.38 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 130 aa  183  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 129 aa  183  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 129 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  182  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  76.92 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  73.44 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  73.6 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  73.02 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  65.57 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  72 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  73.39 
 
 		 134 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  71.2 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 131 aa  176  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  74.22 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  80.87 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  73.33 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  71.77 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 131 aa  174  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2687  30S ribosomal protein S11  80.87 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2372  30S ribosomal protein S11  80.87 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3726  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  73.23 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  173  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>