More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1632 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  54.69 
 
 
207 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  53.97 
 
 
299 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.32 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  54.26 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  53.03 
 
 
196 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 
194 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  51.24 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  60.87 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  42.51 
 
 
191 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  49.24 
 
 
249 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  46.53 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  45.89 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  58.47 
 
 
212 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.63 
 
 
239 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  54.03 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  40.18 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 
251 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 
234 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  47.48 
 
 
280 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  47.52 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  44.85 
 
 
362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 
318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.25 
 
 
438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  56.86 
 
 
199 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  52.5 
 
 
189 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  54.78 
 
 
218 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  57.41 
 
 
261 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 
326 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  50.38 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  45.77 
 
 
217 aa  124  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.76 
 
 
202 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 
189 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  62 
 
 
206 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
329 aa  124  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.76 
 
 
226 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 
198 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  49.24 
 
 
204 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  51.26 
 
 
280 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 
208 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  46 
 
 
188 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
261 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  51.72 
 
 
362 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  54.05 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  32.78 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.38 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  33.2 
 
 
238 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.89 
 
 
368 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
247 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  42.65 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  50.41 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  37.56 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  51.59 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  42.65 
 
 
261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  42.65 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  50.88 
 
 
174 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  47.41 
 
 
328 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 
297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  49.18 
 
 
197 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 
261 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  41.03 
 
 
297 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 
283 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
354 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  42.65 
 
 
261 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  42.65 
 
 
261 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  42.65 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.04 
 
 
370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  49.18 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  46.09 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50.42 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  56.31 
 
 
208 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 
263 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 
304 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  51.4 
 
 
325 aa  111  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.62 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  49.54 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
158 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.79 
 
 
305 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 
204 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
146 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  45.74 
 
 
442 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  44.92 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  49.19 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>