96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1533 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 89 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  31.43 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  54.76 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  29.76 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  34 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  41.18 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  37.84 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  31.51 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  32.5 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.25 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  39.58 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  39.58 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  29.17 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  43.14 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3598  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  30.38 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 63 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  30.49 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 74 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 74 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2854  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.060593  normal  0.309086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  31.11 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  30.12 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3658  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 126 aa  40.8  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000015215  hitchhiker  0.000000741444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  31.11 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  32.65 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  35.56 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  28.79 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  35.56 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 126 aa  40  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 79 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4448  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 127 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00605491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3646  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 127 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.72376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>