More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1510 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 
151 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  70.67 
 
 
158 aa  226  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  59.74 
 
 
154 aa  207  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 
149 aa  197  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  60.67 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 
149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 
153 aa  197  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 
153 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  58.78 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  58.28 
 
 
163 aa  191  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
150 aa  191  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 
163 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 
150 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  184  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
150 aa  184  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  51.66 
 
 
158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
150 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 
150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  52.98 
 
 
151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 
150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
154 aa  180  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
153 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
150 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  55.1 
 
 
150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  54.3 
 
 
156 aa  177  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
147 aa  176  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  56.08 
 
 
154 aa  176  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
154 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
150 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 
148 aa  172  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  55.26 
 
 
159 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  46.41 
 
 
176 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
150 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
180 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 
156 aa  167  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 
184 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  50 
 
 
170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  47.71 
 
 
175 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  49.02 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  52.98 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 
175 aa  160  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
157 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
157 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 
157 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
174 aa  158  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 
175 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 
154 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 
158 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 
163 aa  157  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
149 aa  157  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 
148 aa  157  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 
147 aa  156  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  156  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  53.06 
 
 
158 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
159 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
159 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  46.36 
 
 
175 aa  156  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 
158 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
159 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
151 aa  154  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 
151 aa  154  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 
179 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 
179 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  45.58 
 
 
152 aa  154  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 
152 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 
154 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  47.62 
 
 
172 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  45.33 
 
 
154 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 
152 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  47.62 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 
154 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  47.33 
 
 
151 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
154 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  41.94 
 
 
159 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 
154 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
159 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>