234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1428 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
163 aa  312  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  41.83 
 
 
181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  37.76 
 
 
166 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  36.18 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
194 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
175 aa  84  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
206 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.85 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.17 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.17 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.37 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  36.92 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.29 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  25.93 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.7 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 
193 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.14 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.56 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.44 
 
 
207 aa  58.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  29.37 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
195 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  24.67 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
165 aa  54.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.83 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.89 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.41 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  22.29 
 
 
159 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  22.29 
 
 
159 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  26.85 
 
 
164 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
156 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.21 
 
 
192 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.03 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  26.03 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.14 
 
 
187 aa  50.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.57 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>