More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1340 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  100 
 
 		 145 aa  296  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  67.63 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  66.9 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  59.57 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  58.33 
 
 		 146 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  60.28 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  60.42 
 
 		 159 aa  190  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  63.38 
 
 		 145 aa  189  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  57.45 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  55.56 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  55.32 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  60.45 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  60.87 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  59.29 
 
 		 152 aa  169  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  55.94 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  52.82 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  53.28 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  54.23 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  54.23 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.48 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  52.48 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  51.02 
 
 		 170 aa  159  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  52.52 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  52.14 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  52.14 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  54.07 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  54.68 
 
 		 154 aa  156  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.77 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  55.8 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  55.07 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  51.45 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  50.7 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  55.07 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  54.01 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  50.36 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  53.96 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  51.77 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  50.35 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  50.7 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  51.43 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 269 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  51.08 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50.72 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  53.73 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  51.02 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  48.23 
 
 		 154 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  48.94 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  51.11 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  51.09 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  52.9 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  51.49 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  51.49 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  51.47 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  51.47 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  51.49 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  51.11 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  50.36 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  49.66 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  50.36 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  52.55 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  51.45 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.36 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  47.45 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  49.31 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  51.11 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  51.11 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  50.75 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  49.28 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  51.11 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  51.82 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  48.98 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  50.76 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  49.64 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0706  ribonuclease H  56.88 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.572232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  51.06 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  49.64 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>