More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1335 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  100 
 
 
551 aa  1091    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
566 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.67 
 
 
570 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
573 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 
559 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 
567 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 
573 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 
565 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 
579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.42 
 
 
579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 
579 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 
558 aa  340  5e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  36.12 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  37.73 
 
 
565 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 
565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 
579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 
577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 
579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.9 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 
579 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 
558 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 
579 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 
579 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 
559 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 
559 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 
554 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.57 
 
 
555 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 
553 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.39 
 
 
555 aa  323  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 
579 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32 
 
 
556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 
557 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 
580 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 
562 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 
572 aa  316  9e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 
552 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 
565 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
553 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  39.31 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
572 aa  312  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 
558 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 
556 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 
555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 
578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 
586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.75 
 
 
562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 
554 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 
569 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 
561 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 
560 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 
560 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.89 
 
 
553 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.89 
 
 
553 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 
553 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.89 
 
 
553 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.89 
 
 
553 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 
574 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.29 
 
 
601 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.71 
 
 
553 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.71 
 
 
553 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.71 
 
 
553 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31.53 
 
 
553 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  31.78 
 
 
572 aa  286  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
553 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  32.68 
 
 
560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  31.21 
 
 
574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  31.36 
 
 
553 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.98 
 
 
588 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 
567 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 
557 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  30.3 
 
 
587 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.25 
 
 
553 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
562 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  31.23 
 
 
553 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  30.94 
 
 
553 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.18 
 
 
554 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  30.94 
 
 
553 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  30.94 
 
 
553 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  30.89 
 
 
553 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  30.89 
 
 
553 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  30.89 
 
 
553 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.42 
 
 
608 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  30.71 
 
 
553 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  31.94 
 
 
599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.05 
 
 
556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.17 
 
 
556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  31.59 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  29.17 
 
 
580 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  30.5 
 
 
583 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  32.63 
 
 
555 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 
588 aa  273  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 
568 aa  273  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 
556 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  28.3 
 
 
577 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 
568 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  27.47 
 
 
584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 
550 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>