More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1308 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 369 aa  729    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.31 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  41.96 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  42.23 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.5 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  38.77 
 
 		 377 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 371 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  40.94 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  40.94 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.29 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.58 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.4 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  38.78 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 412 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.99 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  39.25 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  38.2 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.19 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  37.57 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.67 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.17 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  35.71 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 368 aa  222  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.18 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.16 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.27 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.2 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.27 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  38.14 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  38.65 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  38.14 
 
 		 381 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  39.56 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  35.68 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.28 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  39.1 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 417 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 417 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.61 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  38.34 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.84 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.82 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  35.79 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 380 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 372 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  41.03 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.91 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.24 
 
 		 423 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  34.36 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  38.34 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  40.73 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  34.79 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  40.32 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  32.87 
 
 		 386 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  37.78 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  36.68 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  36.68 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  36.96 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.38 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>