More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1204 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
171 aa  335  1e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.44125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  69.51 
 
 
164 aa  241  4e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.14962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  62.8 
 
 
164 aa  222  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.44552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  61.68 
 
 
202 aa  220  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 
164 aa  218  2e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 
187 aa  212  2e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  60.48 
 
 
190 aa  211  5e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.48528e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  60.53 
 
 
152 aa  209  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
195 aa  206  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.17232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
195 aa  206  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.45665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
195 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.20658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
195 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.32272e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 
195 aa  206  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.25648e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
186 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  6.90292e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 
165 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  56.17 
 
 
179 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 
225 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 
238 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 
166 aa  201  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.01645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 
166 aa  201  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.2216e-07  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
166 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
166 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.60309e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 
166 aa  199  1e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.11711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 
219 aa  200  1e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 
198 aa  199  2e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 
176 aa  197  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.25 
 
 
154 aa  195  2e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 
154 aa  191  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  8.64988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 
181 aa  189  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 
177 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  61.59 
 
 
176 aa  186  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 
177 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
252 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
183 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
177 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
183 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  58.45 
 
 
145 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.06668e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
183 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  50.92 
 
 
170 aa  181  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.56408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
178 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
179 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 
164 aa  179  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.72838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
178 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 
182 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
185 aa  178  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 
186 aa  178  4e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 
175 aa  177  5e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  3.17297e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
184 aa  177  5e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
202 aa  177  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 
146 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88109e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  57.76 
 
 
200 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.39127e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  57.76 
 
 
200 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.96833e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
177 aa  175  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 
177 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 
177 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  1.18732e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
396 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 
177 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
225 aa  174  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 
227 aa  174  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
356 aa  174  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.87235e-11 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.93 
 
 
222 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
201 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  59.48 
 
 
153 aa  174  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.72282e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
212 aa  173  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 
186 aa  173  9e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
177 aa  173  1e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.59634e-09 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  48.17 
 
 
401 aa  172  2e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  47.31 
 
 
171 aa  172  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
199 aa  172  2e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
205 aa  172  2e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  49.07 
 
 
197 aa  172  2e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 
182 aa  172  3e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 
190 aa  172  3e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 
194 aa  171  4e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  54.17 
 
 
173 aa  171  4e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.44129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
357 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
250 aa  171  6e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 
173 aa  171  7e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  6.92224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.3 
 
 
175 aa  170  8e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
238 aa  170  8e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
238 aa  170  8e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
172 aa  170  8e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
238 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
172 aa  169  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.34184e-28 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 
194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 
194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
204 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 
175 aa  169  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.87486e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  46.75 
 
 
178 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
243 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  49.38 
 
 
249 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 
196 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
277 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  46.39 
 
 
243 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 
173 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 
177 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 
239 aa  167  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 
174 aa  167  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 
204 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>