256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1142 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  100 
 
 		 857 aa  1674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  29.93 
 
 		 859 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  29.59 
 
 		 859 aa  303  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  31.06 
 
 		 859 aa  294  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.25 
 
 		 1016 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.25 
 
 		 1031 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  42.22 
 
 		 1008 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  41.48 
 
 		 1008 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.7 
 
 		 1007 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  36.39 
 
 		 1023 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  32.18 
 
 		 1008 aa  174  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.41 
 
 		 1007 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  41.46 
 
 		 1022 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  42.5 
 
 		 1022 aa  164  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.05 
 
 		 1003 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  38.2 
 
 		 1019 aa  160  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.73 
 
 		 789 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  19.81 
 
 		 906 aa  117  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  28.76 
 
 		 961 aa  112  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  26.45 
 
 		 891 aa  102  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.33 
 
 		 926 aa  99.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  29.95 
 
 		 904 aa  98.6  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 1061 aa  95.5  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  29.47 
 
 		 851 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  32.5 
 
 		 1029 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  22.13 
 
 		 812 aa  89.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 		 994 aa  86.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  17.5 
 
 		 881 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  26.91 
 
 		 993 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  25.38 
 
 		 815 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.7 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.86 
 
 		 1165 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  26.48 
 
 		 1039 aa  80.5  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.47 
 
 		 1029 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  26.62 
 
 		 1020 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  24.82 
 
 		 1099 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  30.39 
 
 		 993 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.91 
 
 		 858 aa  79  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  28.64 
 
 		 1011 aa  79  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  31.02 
 
 		 1000 aa  78.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  30.39 
 
 		 993 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.11 
 
 		 978 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 		 824 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  27.19 
 
 		 1227 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25 
 
 		 1029 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  27.41 
 
 		 1224 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  22.49 
 
 		 1018 aa  74.3  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  29.68 
 
 		 995 aa  73.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  27.34 
 
 		 1227 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.41 
 
 		 1019 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  28.36 
 
 		 1308 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24.47 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  29.25 
 
 		 1155 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.74 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.79 
 
 		 1029 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  21.42 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  29.9 
 
 		 1116 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.49 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 935 aa  72  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.74 
 
 		 1029 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.74 
 
 		 1029 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.74 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.74 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.93 
 
 		 864 aa  71.2  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  25.79 
 
 		 1219 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  22.14 
 
 		 910 aa  70.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.98 
 
 		 1059 aa  70.5  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  23.79 
 
 		 1029 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  26.16 
 
 		 1032 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  26.04 
 
 		 1227 aa  70.1  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  23.59 
 
 		 1018 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.8 
 
 		 1172 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  32.42 
 
 		 1049 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.8 
 
 		 1172 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  24.95 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  24.75 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  23.26 
 
 		 790 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.76 
 
 		 1108 aa  68.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  30.87 
 
 		 953 aa  68.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  24.92 
 
 		 1227 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  27.69 
 
 		 1013 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 		 1020 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.1 
 
 		 1234 aa  68.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  25 
 
 		 1017 aa  68.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  24.08 
 
 		 852 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.24 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.25 
 
 		 895 aa  67.8  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  23.72 
 
 		 1018 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  23.39 
 
 		 1018 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  24.29 
 
 		 1103 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  30.41 
 
 		 1046 aa  67.8  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  28.78 
 
 		 1247 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.08 
 
 		 1018 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 1018 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  28.72 
 
 		 1009 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  28.72 
 
 		 1009 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  23.19 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  22.86 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.05 
 
 		 1180 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  24.58 
 
 		 1081 aa  65.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>